根据《建设工程施工专业分包合同(示范文本)》规定，专业工程分包人应承担违约责

问题：

A.未能及时办理与分包工程相关的各种证件、批件
B.未履行总包合同中与分包工程有关的承包人的义务与责任
C.经承包人允许，分包人直接致函发包人或工程师
D.已竣工工程未交付承包人之前，发生损坏
E.为施工方便，分包人直接接受发包人或工程师的指令

参考答案：B,D,E

参考解析：

【解析】本题综合考察《建设工程施工专业分包合同(示范文本)》中有关工程承包人和专业工程分包人的主要责任和义务规定。承包人应负责向分包人提供与分包工程相关的各种证件、批件和相关资料。分包人应履行并承担总包合同中与分包工程有关的承包人的所有义务和责任；未经承包人允许，分包人不得以任何理由与发包人或工程师发生直接工作联系；已竣工工程未交付承包人前，分包人负责已完分包工程的成品保护工作。因此，选项BDE正确。